AE Innovation è stata da sempre caratterizzata da una forte vocazione alla Ricerca e all'Innovazione nel settore energetico e dell'automazione. Ciò gli ha permesso di partecipare a diversi progetti di ricerca in collaborazione con diverse Università ed altri Enti Pubblici.
L'area R&S di AE Innovation si avvale di importanti collaborazioni con enti di ricerca e partner universitari che hanno permesso, grazie anche al completo ed attrezzato Laboratorio di Elettronica, di realizzare una serie di prototipi per il mondo Energy e dell'Automazione. Molti di questi prototipi sono poi diventati dei prodotti industriali, completando i normali processi di certificazione CE.